1.饲料级原粮菌剂是一种活性菌，施用时必须埋于土壤中，不能撒施于地表，一般深施7~10cm.
2.由于生物菌对作物的根系和种子不造成任何伤害，所以菌肥施用时应更大限度地靠近作物根系，让其与作物根系更大限度地接触，才能充分发挥生物菌肥的肥效。
3.作种肥时，施于种子正下方2~3cm处；
4.作追肥时尽量靠近根系为好；
5.液体菌剂叶面喷施时，应在下午3时后进行，并喷施于叶的背面，防止紫外线杀死菌种。
6.饲料级原粮菌剂不是高效肥，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前7~10天施用，效果更佳。
7.饲料级原粮菌剂与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥（如硫酸钾等）以及稻草灰混合用，因为这些药、肥，很容易杀死生物菌。或者先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。千万防止与未腐熟的农家肥混肥。
饲料级原粮菌剂与矿源黄腐酸钾配施的好处
1.加入有机肥可以提高肥效的利用率，延长肥效
2.可以入有机肥可以有效地调节酸碱度，保持土壤的酸碱性，减轻土壤板结的情况
3.促进作物根系的生长，补充土壤的有机质